Задрали уже эти "ща мы вам покажем нечто новое и незабываемое". До них всё уже давно продумано.

1. Новые экстренные полномочия, делающие Палыча главнокомандующим, благодаря чему происходит переключение клонов на подчинение канцлеру, а не джедаям.
2. Рождающееся недоверие клонов-солдат и коммандос к джедаям. Больше всего наблюдается в рядах 501-ого легиона, в отряде Омеги. Блай размышляет о верности приказов его генерала Секуры, на примере предателя Воса, который по всем протоколам просто обязать быть мёртвым, но нет - Секура против. В сочетании с вопросами "а как мы будем жить после войны" (кстати, ВК и тут не успело соригинальничать - ранее уже было у Тревисс) это создаёт нормальную обстановку перед 66-ым. И так далее.
3. Блестящая партия в кабинете канцлера, с последующим "заговором джедаев". Сопровождается аудио-записью и построением логичной схемы, хотя и не без косяков.
4. Дабы частично сгладить косяки, верный Вейдер и не менее верные ребята из 501-ого легиона отправляются на зачистку в храм.
5. Клоны-солдаты оспорить приказ главнокомандующего не могут - у них это на генетическом уровне. Приказ отдаётся офицерам, приставленным к джедаям, а уж те переадресовывают подчинённым, которым ничего не остаётся. Есть такие, которые смерти джедаев жаждут - Файе, у него ранее не сложилось с Восом.
6. Так называемое воображение и творческий потенциал клонов - идеальные средства для личных оправданий. В момент убийства Ки-Ади-Мунди Бакара думал, по какой же причине джедаи предали Республику, и как клоны могли доверять джедаям.
7. Однако с коммандос сложнее, их большая независимость и то же воображение может создать проблемы. Сержант Скалолаз додумался до того, что приказ могли отдать сепаратисты, взломавшие шифр Республики или что-то в этом роде. И такие исключения из правил тоже логичны.

Чего тут ещё добавлять, не понимаю. Они ж наоборот хуже сделают.